Sous le nom de Cort, dans un document du pape Eugène III4, on trouve la première mention écrite de Court. Le 17 février 1179, on trouve le toponyme Curt dans un acte du pape Alexandre III. Ce document mentionne également les hameaux de Chavanney, à l'entrée du vallon de Chaluet, et de Minvilier, à l'ouest de la localité. Ces deux hameaux furent complètement détruits par les épidémies de peste du XVIe siècle.
La route des gorges de Court à Moutier fut achevée en 1752 par le prince-évêque de Bâle Rinck de Baldenstein. Auparavant, la Vallée de Tavannes était reliée à Moutier par la route Bévilard-Champoz-Perrefitte.
La découverte de l’ancien village Minvilier
En 1996, des fouilles archéologiques à l’ouest de Court permirent de retrouver des traces de l'ancien village Minvilier (ou Mévilier), habité du XIIe au XVe siècle et abandonné après une épidémie de peste.
Lors d’autres fouilles, quatre verreries ont été localisées à Chaluet. Elles furent actives entre 1657 et 1714, sur des emplacements différents. Les verriers, venus probablement de Forêt-Noire.
Les originaires
Les familles Bueche, Chausse, Lardon, Marchand, Rossé, Serquet et Richon sont originaires de Court.
La commune de Court reste indépendante
Le 22 septembre 2013, le projet de fusion de Valbirse avec les communes de Bévilard, Malleray, Pontenet et Sorvilier est refusé à la suite du rejet de la commune.